Інститут має угоди про співпрацю із:

• Інститутом регіональної географії (Німеччина, м. Лейпціг) про співробітництво в області економічної і соціальної географії та екології;
• Інститутом географії АН Угорщини (м. Будапешт) про співробітництво в галузі дослідження природних і господарських систем регіонів, дослідження природно-ресурсного і соціально-економічного потенціалів регіонів; дослідження і збереження навколишнього природного середовища; збереження ландшафтного та біологічного різноманіття, розробки і впровадження механізмів збалансованого розвитку регіонів;
• Інститутом географії при Академії наук і Технологій В’єтнаму (м.Ханой) про співробітництво щодо вирішення пріоритетних географічних задач: вивчення природних умов і господарських задач регіонів обох країн; дослідження природно-ресурсного і соціально-економічного потенціалу регіонів; вивчення стану навколишнього середовища; збереження ландшафтного і біологічного різноманіття тощо.

В межах Генеральної угоди з Інститутом географії АН Угорщини в результаті спільних робіт видано монографію «Ukraine in maps».

В рамках довгострокового Договору про співробітництво між Російською академією наук і Національною академією наук України Інститут співпрацює на основі конкретних угод з Інститутом географії Російської академії наук у різних аспектах фундаментальних і прикладних географічних досліджень в області природничої, економічної та соціальної географії, екології, а також – з Інститутом озерознавства РАН, Камчатським Інститутом екології та природокористування Далекосхідного відділення РАН, Інститутом географії СВ РАН ім. В.Б.Сочави. Серед інших установ – Санкт-Петербурзький державний університет, Інститут геохімії та геофізики НАН Білорусі та ін. Крім того, Інститут географії постійно підтримує контакти з географічними установами країн СНД через Об'єднану наукову раду з фундаментальних географічних проблем Міжнародної асоціації академії наук (МААН).

Співробітництво з зарубіжними партнерами здійснюється також в межах проектів, що фінансуються Національною академією наук, Російським гуманітарним науковим фондом, Українським, Російським та Білоруським фондами фундаментальних досліджень.